<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">pmj</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Тихоокеанский медицинский журнал</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Pacific Medical Journal</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1609-1175</issn><publisher><publisher-name>TGMU</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.34215/1609-1175-2022-2-54-59</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">pmj-2338</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL RESEARCHES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Методы машинного обучения в прогнозировании рецидивов базальноклеточного рака кожи после фотодинамической терапии</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Machine learning methods in prediction of basal cell skin cancer recurrence after photodynamic therapy</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-3062-3404</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Гривков</surname><given-names>Л. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Grivkov</surname><given-names>L. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Гривков Лев Анатольевич, врач-онколог</p><p>690002, г. Владивосток, пр-т Острякова, 2</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Lev A. Grivkov, Oncologist</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4539-685X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шахгельдян</surname><given-names>К. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shahgeldyan</surname><given-names>K. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Шахгельдян Карина Иосифовна, д-р техн. наук, профессор, заведующий лабораторией анализа больших данных в биомедицине и здравоохранении</p><p>690002, г. Владивосток, пр-т Острякова, 2</p></bio><email xlink:type="simple">carinash@vvsu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9250-557X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Гельцер</surname><given-names>Б. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Geltser</surname><given-names>B. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Гельцер Борис Израйльевич, д-р мед. наук, профессор, чл.-корр. РАН, директор департамента клинической медицины</p><p>690002, г. Владивосток, пр-т Острякова, 2</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Boris Izrailevich Geltser - Doctor of Medical Sciences, Professor, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences, Deputy Director for Scientific Work of the School of Medicine</p><p>690920, Vladivostok, Russian Island, village Ajax, 10</p></bio><email xlink:type="simple">boris.geltser@vvsu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-5830-1322</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Котельников</surname><given-names>В. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kotelnikov</surname><given-names>V. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Котельников Владимир Николаевич – д-р мед наук, профессор, заведующий кафедрой медицины катастроф и безопасности жизнедеятельности</p><p>690002, г. Владивосток, пр-т Острякова, 2</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Vladimir N. Kotelnikov, Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of chair Disaster Medicine and Life Safety</p></bio><email xlink:type="simple">v.kotelnikov@m.tgmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0808-5283</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Апанасевич</surname><given-names>В. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Apanasevich</surname><given-names>V. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Апанасевич Владимир Иосифович, д-р мед наук, профессор, кафедра онкологии с курсом лучевой терапии</p><p>690002, г. Владивосток, пр-т Острякова, 2</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Vladimir I. Apanasevich, Doctor of Medical Sciences, Professor, Chair of Oncology with a Course of Radiation Therapy</p></bio><email xlink:type="simple">a.apanasevich@m.tgmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Приморский краевой онкологический диспансер</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Primorsky Regional Oncological Dispensary</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>Владивостокский государственный университет экономики и сервиса, Институт информационных технологий</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Vladivostok State University of Economics and Service, Institute of Information Technologies</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-3"><aff xml:lang="ru"><institution>Дальневосточный федеральный университет, Школа медицины</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Far Eastern Federal University, School of Medicine</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-4"><aff xml:lang="ru"><institution>Тихоокеанский государственный медицинский университет</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Pacific State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2022</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>22</day><month>06</month><year>2022</year></pub-date><volume>0</volume><issue>2</issue><fpage>54</fpage><lpage>59</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Гривков Л.А., Шахгельдян К.И., Гельцер Б.И., Котельников В.Н., Апанасевич В.И., 2022</copyright-statement><copyright-year>2022</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Гривков Л.А., Шахгельдян К.И., Гельцер Б.И., Котельников В.Н., Апанасевич В.И.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Grivkov L.A., Shahgeldyan K.I., Geltser B.I., Kotelnikov V.N., Apanasevich V.I.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.tmj-vgmu.ru/jour/article/view/2338">https://www.tmj-vgmu.ru/jour/article/view/2338</self-uri><abstract><p>Цель: верификация предикторов и прогнозирование рецидивов базальноклеточного рака кожи (БКРК) после проведения фотодинамической терапии (ФДТ) на основе методов машинного обучения (МО).Материал и методы. Проведено проспективное исследование 170 пациентов (117 женщин и 53 мужчины) в возрасте с медианой 68 лет, проходивших лечение ФДТ по поводу БКРК. Анализировали потенциальные предикторы БКРК. Конечной точкой исследования был факт развития рецидива опухоли.Результаты. За 4-летний период наблюдения рецидивы заболевания имели место у 18 (10,6%) пациентов. Обработка и анализ данных с помощью методов машинного обучения (МО) позволили выделить предикторы, линейно и нелинейно связанные с развитием рецидива БКРК. К ним относились: II стадия процесса, его склеродермоподобная форма, локализация в области грудной клетки, уровни СОЭ и глюкозы в крови. Наиболее точный прогноз рецидивов БКРК был получен с помощью модели на основе многофакторной линейной регрессии (ЛР), что подтверждалось высокими значениями метрик качества (площадь под ROC-кривой – 0,893, чувствительность – 0,849, специфичность – 0,889). Прогностическая точность модели стохастического градиентного бустинга (СГБ) была менее заметной.Заключение. ФДТ относится к эффективным методам лечения БКРК, что подтверждается результатами проспективного наблюдения за пациентами в течение четырех лет. Методы МО – информативный инструмент для верификации предикторов и прогнозирования рецидивов БКРК. Прогностические модели на основе многофакторной ЛР обладают более высокой точностью по сравнению с СГБ.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Objective: Verification of predictors and forecasting basal cell skin cancer recurrence (BCSC) after conducting photodynamic therapy (PDT) based on machine learning methods (ML).Methods: The prospective study of 170 patients (117 women and 53 men) was conducted. The median age was 68 years. All patients got PDT treatment on BCSC. Potential predictors of BCSC were analyzed. Primary outcome measure was the fact of tumor development recurrence.Results: During 4-year observation period the recurrence of the disease took place in 18 cases (10.6% of patients). Processing and analyzing data with the assistance of machine learning methods (ML) allowed to highlight the predictors connected with the development of BCSC recurrence development linearly and non linearly. There are such predictors as: 2nd stage of the process, its morphea-like form, localization in the thoracic cage area, the level of ESR and glucose in the blood. The most accurate forecast of BCSC recurrence was gotten using model based on multiple linear regression (LR). It was proved by high levels of quality indexes (the area under ROCcurve – 0.893, sensitivity – 0.849, specificity – 0.889). Predictive accuracy of the stochastic gradient boosting model (SGB) was less significant.Conclusions. PDT is an effective BCSC treatment method. It is proved by the results of prospective observation of patients for the period of 4 years. ML methods are an informative tool to verify predictors and forecast BCSC recurrence. Forecasting models based on multiple LR demonstrate much higher accuracy compared with SGB.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>методы машинного обучения</kwd><kwd>фотодинамическая терапия</kwd><kwd>базальноклеточный рак кожи</kwd><kwd>прогностические моде</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>machine learning methods</kwd><kwd>photodynamic therapy</kwd><kwd>basal cell skin cancer</kwd><kwd>predictive model</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Работа выполнена при частичной финансовой поддержке гранта РФФИ в рамках научного проекта 18-29-03131.</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Каприн А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Злокачественные новообразования в России в 2018 году (заболеваемость и смертность). М.: МНИОИ им. П.А. Герцена, 2019:250.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kaprin A.D., Starinskiy V.V., Petrova G.V. Malignant neoplasms in Russia in 2018 (morbidity and mortality). M .: MNIOI them. P.A. Herzen, 2019: 250. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Волгин В.Н., Странадко Е.Ф., Тришкина О.В., Кабанова М.А., Кагоянц Р.В. Сравнительная характеристика различных видов лечения базально-клеточного рака кожи. Российский журнал кожных и венерических болезней. 2013; 5: 4-10.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Volgin V.N., Stranadko E.F., Trishkina O.V., Kabanova M.A., Kagoyants R.V. Comparative characteristics of different types of treatment for basal cell skin cancer. Russian Journal of Skin and Venereal Diseases. 2013; 5: 4-10. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Lai SY, Weber RS. High-risk non-melanoma skin cancer of the head andneck. CurrOncol Rep USA. 2005; 7 (2): 154-8.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lai SY, Weber RS. High-risk non-melanoma skin cancer of the head andneck. CurrOncol Rep USA. 2005; 7 (2): 154-8.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шляхтунов Е.А., Гидранович А.В., Луд Н.Г., Луд Л.Н., Кожар В.Л., Прокшин А.В. Рак кожи: современное состояние проблемы. Вестник ВГМУ. 2014; 3: 20-8.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shlyakhtunov E.A., Gidranovich A.V., Lud N.G., Lud L.N., Kozhar V.L., Prokshin A.V. Skin cancer: current state of the art. Vestnik VSMU. 2014; 3: 20-8 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Василевская Е.А., Варданян К.Л., Дзыбова Э.М. Современные методы лечения базально-клеточного рака кожи. Клиническая дерматология и венерология. 2015; 3: 4-11.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Vasilevskaya E.A., Vardanyan K.L., Dzybova E.M. Modern methods of treatment for basal cell skin cancer. Clinical Dermatology and Venereology. 2015; 3: 4-11. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Капинус В.Н., Каплан М.А., Сокол Н.И., Ярославцева-Исаева Е.В., Спиченкова И.С., Каприн А.Д., Иванов С.А. Предикторы рецидивов базальноклеточного рака кожи после проведения фотодинамической терапии с фотосенсибилизатором. Лазерная медицина. 2019; 23 (4): 28-37.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kapinus V.N., Kaplan M.A., Sokol N.I., Yaroslavtseva-Isaeva E.V., Spichenkova I.S., Kaprin A.D., Ivanov S.A. Predictors of recurrence of basal cell skin cancer after photodynamic therapy with a photosensitizer. Laser medicine. 2019; 23 (4): 28-37. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Коршунова О.В., Плехова Н.Г. Фотодинамическая терапия в онкологии: настоящее и будущее Тихоокеанский медицинский журнал. 2020;(4):15-9.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Korshunova O.V., Plekhova N.G. Photodynamic therapy in oncology: present and future Pacific Medical Journal. 2020; (4): 15-9 (In Russ.) doi: 10.34215/1609-1175-2020-4-15-19</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рябов М.В., Странадко Е.Ф., Волкова Н.Н. Фотодинамическая терапия местно-распространенного базально-клеточного рака кожи. Лазерная медицина. 2004; 1: 18-24.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ryabov M.V., Stranadko E.F., Volkova N.N. Photodynamic therapy of locally advanced basal cell skin cancer. Laser medicine. 2004; 1: 18-24. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Javier Andreu-Perez, Poon CCY, Merrifield RD, Wong STC, Yang G-Zh. Big Data for Health. IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics. 2015; 19(4): 1193-1208.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Javier Andreu-Perez, Poon CCY, Merrifield RD, Wong STC, Yang G-Zh. Big Data for Health. IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics. 2015; 19(4): 1193-1208.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
