<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">pmj</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Тихоокеанский медицинский журнал</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Pacific Medical Journal</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1609-1175</issn><publisher><publisher-name>TGMU</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.34215/1609-1175-2022-3-24-31</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">pmj-2356</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОБЗОРЫ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>REVIEWS</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Механизм передачи паразита как инструмент эволюции и критерий систематики инфекционных болезней</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>The mechanism of parasite transmission as a tool of evolution and a criterion for a taxonomy of infectious disease</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9495-6190</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Колпаков</surname><given-names>С. Л.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kolpakov</surname><given-names>S. L.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>канд. мед. наук, доцент, доцент кафедры эпидемиологии и военной эпидемиологии,</p><p>690002, г. Владивосток, пр-т Острякова, 2</p></bio><bio xml:lang="en"><p>PhD, assistant prof. of Dept. of epidemiology and military epidemiology, </p><p>2, Ostryakova Ave., Vladivostok, 690002</p></bio><email xlink:type="simple">kolpakovsl@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Тихоокеанский государственный медицинский университет</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Pacific State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2022</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>07</day><month>09</month><year>2022</year></pub-date><volume>0</volume><issue>3</issue><fpage>24</fpage><lpage>31</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Колпаков С.Л., 2022</copyright-statement><copyright-year>2022</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Колпаков С.Л.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Kolpakov S.L.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.tmj-vgmu.ru/jour/article/view/2356">https://www.tmj-vgmu.ru/jour/article/view/2356</self-uri><abstract><p>В обзоре рассматриваются принципы построения эпидемиологических классификаций инфекционных болезней. Дается обоснование того, что принципам систематики соответствует сочетание морфологического, «форма и симметрия» паразитов, и функционального, механизм передачи возбудителя, или «функция и энергия», подходов. Обсуждается положение о том, что механизм передачи возбудителя является эволюционным инструментом, реализуемым в эпидемическом процессе. Механизмы передачи классифицируются на: обеспечивающие воспроизводство (наследственный, вертикальный и контактный), обеспечивающие метаболические процессы (некрофагальный, водно-почвенный, плотоядный для инфекций животных и растений) и трансмиссивный (для животных и человека), фекально-оральный и аэрозольный. В качестве примера обосновывается гипотетическая модель эволюции вирусов на основе их механизмов передачи. </p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>This review discusses the principles of constructing epidemiological classifications of infectious diseases. A rationale is provided that taxonomy principles correspond to a combination of morphological and functional approaches. The former covers the shape and symmetry of parasites, while the latter is based on pathogen transmission mechanisms or the ‘function-and-energy’ approach. The idea that pathogen transmission mechanisms are an evolutionary tool implemented in the epidemic process is discussed. Transmission mechanisms are classified into those ensuring reproduction – hereditary, vertical, and contact, those supporting metabolic processes – necrophage, water-soil, and carnivorous for animal and plant infections, as well as those enabling transmission (for animals and humans) – fecal-oral and aerosol. As an example, a hypothetical model of the evolution of viruses based on their transmission mechanisms is substantiated. </p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>механизм передачи</kwd><kwd>классификация</kwd><kwd>инфекционные болезни</kwd><kwd>эпидемический процесс</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>transmission mechanism</kwd><kwd>classification</kwd><kwd>infectious diseases</kwd><kwd>epidemic process</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Громашевский Л.В. Общая эпидемиология. Руководство для врачей и студентов санитарно-гигиенических факультетов. М.: Медицина, 1965.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Gromashevskij LV. Obshhaya epidemiologiya. Rukovodstvo dlya vrachejistudentov sanitarnogigienicheskix fakultetov. Moscow: Medicine; 1965 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Громашевский Л.В. Теоретические вопросы эпидемиологии: Избранные труды. В 3 т. Т. 2. Киев: Здоров›я; 1987.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Gromashevskij LV. Teoreticheskie voprosy epidemiologii: Izbrannye trudy. V 3 t. T. 2. Kiev: Zdorov’ya; 1987 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Сталлибрасс К. Основы эпидемиологии. Москва – Ленинград: Государственное издательство биологической и медицинской литературы, 1936.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Stallibrass K. Osnovy epidemiologii. Moscow – Leningrad: Gosudarstvennoe izdatelstvo biologicheskoj i medicinskoj literatury; 1936 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Эпидемиология: учебник. Под ред. Беляков В.Д., Яфаев Р.Х. М.: Медицина, 1989.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Belyakov VD, Yafaev RKh, editors. Epidemiology. Textbook. Moscow: Medicine; 1989 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Частная эпидемиология: Руководство для врачей. Под ред. Черкасский Б.Л. М., 1994.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Cherkasskij BL, editor. Chastnaya epidemiologiya: Rukovodstvo dlya vrachej. Moscow; 1994 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Эпидемиология. Под ред. Елкин И.И. М.: Медицина, 1979.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Elkin II. editor. Epidemiologiya. Moscow: Medicine; 1979 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Белов А.Б. К вопросу о классификации инфекционных болезней человека по механизмам передачи их возбудителей. Эпидемиология ивакцинопрофилактика. 2013; 70(3): 8–16.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Belov AB. Some Aspects of Classification of Human Infectious Diseases According to the Mechanisms of Pathogen Transmission. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2013; 70(3): 8–16 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Клиорин А.И. В.Д. Беляков и концепция номогенеза (ортогенеза, автоэволюции). Достижения отечественной эпидемиологии в ХХ веке. Взгляд в будущее. Под ред. Огаркова П.И., Иванникова Ю.Г. СПб., 2008; 11–15.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kliorin AI, Belyakov VD. i koncepciya nomogeneza (ortogeneza, avtoevolyucii). In: Ogarkov PI, Ivannikov YuG editors. Dostizheniya otechestvennoj epidemiologii v XX veke. Vzglyad v budushhee. SPb.; 2008; 11–15 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шкарин В.В., Давыдова Н.А., Никифоров В.А., Жданов Е.Е. Рецензии и критика. Журн. Микробиол. 1992; 4: 73–75.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shkarin VV, Davydova NA, Nikiforov VA, Zhdanov EE. Recenzii i kritika. Zhurn. Mikrobiol. 1992; 4: 73–75 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Беляков В.Д. Эволюция структуры медицинской науки и ее отражение в системе медицинского образования: Актовая речь. М.; 1989.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Belyakov VD. Evolyuciya struktury medicinskoj nauki i ee otrazhenie v sisteme medicinskogo obrazovaniya: Aktovaya rech. Moscow; 1989 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лима-де-Фариа А. Эволюция без отбора. Автоэволюция формы и функции. М.: Мир, 1991.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lima-de-Faria A. Evolyuciya bez otbora. Avtoevolyuciya formy i funkcii. Moscow: Mir; 1991 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Белов А.Б. Инновационный подход к решению теоретических вопросов эколого-эпидемиологической концепции сапранозов. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2018; 1(98): 87–94.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Belov AB. Innovative Approach to Solving Theoretical Issues of the Ecological and Epidemiological Concept of Sapronoses. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2018; 1(98): 87–94 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Гегель Г.В.Ф. Наука логики. М.: АСТ, 2019.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Gegel GVF. Nauka logiki. Moscow: AST; 2019 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шляхтенко Л.И., Мукомолов С.А., Нечаев В.В., Крыга Л.Н. Теоретические основы эпидемиологии вирусного гепатита В. Журн. микробиол. 1998; 4: 25–29.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shlyaxtenko LI, Mukomolov SA, Nechaev VV, Kryga LN. Teoreticheskie osnovy epidemiologii virusnogo gepatita V. Zhurn. mikrobiol. 1998; 4: 25–29 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ковалева Е.П. О механизмах передачи инфекции в свете новых данных. Журн. микробиол. 1995; 1: 103–106.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kovaleva EP. O mexanizmax peredachi infekcii v svete novyx dannyx. Zhurn. mikrobiol. 1995; 1: 103–106 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Сергевнин В.И. Механизмы передачи возбудителей и эколого-эпидемиологическая классификация инфекционных и паразитарных болезней человека (точка зрения). Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2012; 2: 4–9.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sergevnin VI. Mechanisms of Transmission and Environmental Epidemiological Classification of Infectious and Parasitic Diseases of Humans (Viewpoint). Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2012; 2: 4–9 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Белов А.Б. Теория механизма передачи возбудителей-паразитов человека и вопросы систематизации инфекционных болезней. Медицина в Кузбассе. 2013; 2(12): 3–9.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Belov AB. The theory of mechanism of human parasites transmission and the issues of infectious diseases systematization. Medicine in Kuzbass. 2013; 2(12): 3–9 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Boeke JD, Stoye JP. Retrotransposons, endogenous retroviruses, and the evolution of retroelements. In: Hughes S, Varmus H. eds. Retroviruses. NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview; 1997; 343–435.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Boeke JD, Stoye JP.  Retrotransposons, endogenous retroviruses, and the evolution of retroelements. In:  Hughes S, Varmus H.   eds.  Retroviruses. NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview; 1997; 343–435.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Jern P, Coffin JM. Effects of retroviruses on host genome function. Annu Rev Genet. 2008; 42:709–732.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Jern P, Coffin JM. Effects of retroviruses on host genome function. Annu Rev Genet.  2008; 42:709–732.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">McPherson JD, et al. International Human Genome Mapping Consortium. A physical map of the human genome. Nature. 2001; 409(6822):934–941.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">McPherson JD, et al. International Human Genome Mapping Consortium.  A physical map of the human genome. Nature.  2001;  409(6822):934–941.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit21"><label>21</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Wildschutte JH, Williams ZH, Montesion M, Subramanian RP, Kidd JM, John MC. Discovery of unfixed endogenous retrovirus insertions in diverse human populations. PNAS April 19, 2016; 113(16): E2326–E2334; https://doi.org/10.1073/pnas.1602336113 (Accessed Dec 6, 2022).</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Wildschutte JH, Williams ZH, Montesion M, Subramanian RP, Kidd JM, John MC. Discovery of unfixed endogenous retrovirus insertions in diverse human populations. PNAS April 19, 2016; 113(16): E2326–E2334; https://doi.org/10.1073/pnas.1602336113 (Accessed Dec 6, 2022).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit22"><label>22</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Прокудина Е.Н., Прокудин В.Н. Возможная роль вирусных инфекций в психических заболеваниях человека (гипотезы и факты). Журн. микробиол. 2002; 1: 47–49.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Prokudina EN, Prokudin VN. Vozmozhnaya rol virusnyx infekcij v psixicheskix zabolevaniyax cheloveka (gipotezy i fakty). Zhurn. mikrobiol. 2002; 1: 47–49 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit23"><label>23</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ряпис Л.А., Брико Н.И., Покровский В.И. Вертикальная передача возбудителей болезней человека и ее соотношение с классическими типами механизма передачи. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2000; 4: 46–49.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ryapis LA, Briko NI, Pokrovskij VI. Vertikalnaya peredacha vozbuditelej boleznej cheloveka i ee sootnoshenie s klassicheskimi tipami mexanizma peredachi. Epidimiology and infectious diseases. 2000; 4: 46–49 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit24"><label>24</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Медуницын Н.В. Прионные болезни и проблемы безопасности биологических препаратов. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2005; 4: 4–6.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Medunicyn NV. Prionnye bolezni i problemy bezopasnosti biologicheskix preparatov. Epidimiology and infectious diseases. 2005; 4: 4–6 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit25"><label>25</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Зильбер Л.А. Вирусо-генетическая теория возникновения опухолей. М.: Наука, 1968.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Zilber LA. Viruso-geneticheskaya teoriya vozniknoveniya opuxolej. Moscow: Nauka; 1968 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit26"><label>26</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Baltimore D. Expression of animal virus genomes. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 1971; 35(3): 235–241. PMID 4329869.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Baltimore D. Expression of animal virus genomes. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 1971; 35(3): 235–241. PMID 4329869.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit27"><label>27</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Серенко А.Ф. Заносные вспышки натуральной оспы. М.: Государственное издательство медицинской литературы, 1962.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Serenko AF. Zanosnye vspyshki naturalnoj ospy. Moscow: Gosudarstvennoe izdatelstvo medicinskoj literatury, 1962 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit28"><label>28</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Колпаков С.Л., Попов А.Ф., Тихонов Н.Ю., Симакова А.И., Иванис В.А., Хомичук Т.Ф. Клинические и эпидемиологические закономерности ветряной оспы у взрослых в Приморском крае. Журнал инфектологии. 2019; 11(3): 32-37. DOI: 10.22625/2072-6732-2019-11-3-32-37</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kolpakov SL, Popov AF, Tihonov NYu, Simakova AI, Ivanis VA, Homichuk TF. Clinical and epidemiological patterns of chickenpox in adults in the Primorsky territory. Journal of Infectology. 2019; 11(3): 32–37 (In Russ.) DOI: 10.22625/2072-6732-2019-11-3-32-37</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit29"><label>29</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Колпаков С.Л., Попов А.Ф., Симакова А.И. Диагностика острых респираторных вирусных инфекций: клинические и эпидемиологические закономерности. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2019; 2(24): 61–68. DOI: 10.18821/1560-9529-2019-24-2-61-68</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kolpakov SL, Popov AF, Simakova AI. Diagnosis of acute respiratory viral infections: clinical and epidemiological regularities. Epidimiology and infectious diseases. 2019; 2(24). 61–68 (In Russ.) DOI: 10.18821/1560-9529-2019-24-2-61-68</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit30"><label>30</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Яковлев А.А. Концепция интеграционно-конкурентного развития эпидемического процесса. Тихоокеанский медицинский журнал. 2006; 3: 10–15.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Jakovlev AA. The concept integrate-competitive development of epidemic process. Pacific Medical Journal. 2006; 3: 10–15 (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
