АНАЛИЗ ГЕНОМОВ ШТАММОВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ОБЛАДАЮЩИХ РАЗЛИЧНОЙ ВИРУЛЕНТНОСТЬЮ ДЛЯ ЧЕЛОВЕКА
Аннотация
Штаммы вируса клещевого энцефалита дальневосточного
субтипа способны вызывать заболевание различной тяжести.
Для определения связи между тяжестью заболевания и структурой генома вируса были определены полногеномные нуклеотидные последовательности штаммов, выделенных как от
умерших людей (высоковирулентные штаммы), так и от лиц, у
которых отсутствовали симптомы заболевания (инаппарантные штаммы). Выявлено, что эти две группы штаммов вируса находятся на филогенетическом древе в разных кластерах.
Кроме того, группы этих штаммов различаются по наличию
19 группоспецифичных мутантных сайтов в вирусных белках. Четыре мутации приводят к существенному изменению
свойств аминокислотных остатков и, вероятно, являются ключевыми, определяющими патогенность штамма.
субтипа способны вызывать заболевание различной тяжести.
Для определения связи между тяжестью заболевания и структурой генома вируса были определены полногеномные нуклеотидные последовательности штаммов, выделенных как от
умерших людей (высоковирулентные штаммы), так и от лиц, у
которых отсутствовали симптомы заболевания (инаппарантные штаммы). Выявлено, что эти две группы штаммов вируса находятся на филогенетическом древе в разных кластерах.
Кроме того, группы этих штаммов различаются по наличию
19 группоспецифичных мутантных сайтов в вирусных белках. Четыре мутации приводят к существенному изменению
свойств аминокислотных остатков и, вероятно, являются ключевыми, определяющими патогенность штамма.
Об авторах
С. И. Беликов
Лимнологический институт СО РАН
Россия
Россия
Г. Н. Леонова
НИИ эпидемиологии и микробиологии СО РАМН
Россия
Россия
И. Г. Кондратов
Лимнологический институт СО РАН
Россия
Россия
Е. В. Романова
Лимнологический институт СО РАН
Россия
Россия
Е. В. Павленко
НИИ эпидемиологии и микробиологии СО РАМН
Россия
Россия
S. Belikov
Institute of Limnology, SB RAMS
Россия
Россия
G. Leonova
Research Institute of Epidemiology and
Microbiology, SB RAMS
Россия
Россия
I. Kondratov
Institute of Limnology, SB RAMS
Россия
Россия
E. Romanova
Institute of Limnology, SB RAMS
Россия
Россия
E. Pavlenko
Research Institute of Epidemiology and
Microbiology, SB RAMS
Россия
Россия
Список литературы
1. Леонова Г.Н., Беликов С.И., Кулакова Н.В. и др. Молекулярное типирование штаммов вируса клещевого энцефалита, выделенных от людей с различной степенью тяжести инфекции на территории юга Дальнего Востока России // Мол. генетика, микробиол. и вирусол. 2004. № 2. С. 32-36.
2. Погодина В.В., Левина Л.С., Карань Л.С. и др. Летальные исходы клещевого энцефалита, вызванного сибирским подтипом возбудителя в европейской части России и на Урале // Мед. вирусол. 2009. Т. XXVI. С. 121-123.
3. Allison S.L., Stiasny K., Stadler C.W. et al. Mapping of functional elements in the stem-anchor region of tick-borne encephalitis virus envelope protein E // J. Virol. 1999. Vol. 73. P. 5605-5612.
4. Chambers T.J., Hahn C.S., Galler R., Rice C.M. Flavivirus genome organization, expression, and replication // Ann. Rev. Microbiol. 1990. Vol. 44. P. 649-688.
5. Combet C., Blanchet C., Geourjon C. Deleage G. NPS@:Network Protein Sequence Analysis // TIBS. 2000. Vol. 25, No. 3. P. 147-150.
6. Lobigs, M., Lee, E. Inefficient signalase cleavage promotes efficient nucleocapsid incorporation into budding flavivirus membranes // J. Virol. 2004. Vol. 78. P. 178-186.
7. Mandl C.W. Steps of the tick-borne encephalitis virus replication cycle that affect neuropathogenesis // Virus Res. 2005. Vol. 111, No. 2. P. 161-174.
8. Rumyantsev A.A., Murphy B.R., Pletnev A.G. A tick-borne Langat virus mutant that is temperature sensitive and host range restricted in neuroblastoma cells and lacks neuroinvasiveness for immunodeficient mice // J. Virol. 2006. Vol. 80, No. 3. P. 1427-1439.
9. Van de Peer, Y., De Wachter, R. TREECON: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees // Comput. Applic. Biosci. 1993. Vol. 9. P. 177-182.
10. Wallis T.P., Huang C.Y., Nimkar S.B. et. al. Determination of the disulfide bond arrangement of dengue virus NS1 protein // J. Biol. Chem. 2004. Vol. 279, No. 20. P. 20729-20741.
11. Yamshchikov V.F., Compans R.W. Processing of the intracellular form of the west Nile virus capsid protein by the viral NS2B-NS3 protease: an in vitro study // J. Virol. 1994. Vol. 68. P. 5765-5771.
Рецензия
Для цитирования:
Беликов С.И., Леонова Г.Н., Кондратов И.Г., Романова Е.В., Павленко Е.В., ., ., ., ., . АНАЛИЗ ГЕНОМОВ ШТАММОВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ОБЛАДАЮЩИХ РАЗЛИЧНОЙ ВИРУЛЕНТНОСТЬЮ ДЛЯ ЧЕЛОВЕКА. Тихоокеанский медицинский журнал. 2010;(3):23-26.
For citation:
., ., ., ., ., Belikov S.I., Leonova G.N., Kondratov I.G., Romanova E.V., Pavlenko E.V. Analy zing Genomes of Tick-Bone Encephalitis Virus Strains with Various Human Virulence. Pacific Medical Journal. 2010;(3):23-26. (In Russ.)
Просмотров: 161
Послать статью по эл. почте 
