МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНОМА ВЫСОКОПАТОГЕННОГО ШТАММА ГЛУБИННОЕ/2004 ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА
Аннотация
Представлен молекулярно-генетический анализ последовательности генома высокопатогенного штамма Глубинное/2004
вируса клещевого энцефалита дальневосточного субтипа.
Сравнение его с геномом других штаммов дальневосточного,
сибирского и европейского субтипов показало, что штамм
Глубинное/2004 несет ряд мутаций в неструктурных вирусных
белках, сайтах процессинга вирусного полипротеина и промоторных последовательностях генома. Эти мутации, вероятно,
могут способствовать ускоренной репликации и созреванию
вируса. Показано, что вторичная структура промоторной
5-концевой области генома, а также расположение трансмембранных доменов в белке NS2A отличают штаммы дальневосточного субтипа от сибирского и европейского субтипов
вируса клещевого энцефалита.
вируса клещевого энцефалита дальневосточного субтипа.
Сравнение его с геномом других штаммов дальневосточного,
сибирского и европейского субтипов показало, что штамм
Глубинное/2004 несет ряд мутаций в неструктурных вирусных
белках, сайтах процессинга вирусного полипротеина и промоторных последовательностях генома. Эти мутации, вероятно,
могут способствовать ускоренной репликации и созреванию
вируса. Показано, что вторичная структура промоторной
5-концевой области генома, а также расположение трансмембранных доменов в белке NS2A отличают штаммы дальневосточного субтипа от сибирского и европейского субтипов
вируса клещевого энцефалита.
Ключевые слова
578.833:57.063.8.575.224.234
Об авторах
Е. В. Чаусов
НИИ эпидемиологии и микробиологии СО РАМН
Россия
Россия
В. А. Терновой
ГНЦ вирусологии и биотехнологии "Вектор"
Россия
Россия
Е. В. Протопопова
ГНЦ вирусологии и биотехнологии "Вектор"
Россия
Россия
Г. Н. Леонова
НИИ эпидемиологии и микробиологии СО РАМН
Россия
Россия
В. Б. Локтев
ГНЦ вирусологии и биотехнологии "Вектор"
Россия
Россия
E. Chausov
Research Institute of Epidemiology and Microbiology, SB RAMS
Россия
Россия
V. Ternovoy
State Research Centre
of Virology and Biotechnology "Vector"
Россия
Россия
E. Protopopova
State Research Centre
of Virology and Biotechnology "Vector"
Россия
Россия
G. Leonova
Research Institute of Epidemiology and Microbiology, SB RAMS
Россия
Россия
V. Loktev
State Research Centre
of Virology and Biotechnology "Vector"
Россия
Россия
Список литературы
1. Леонова Г.Н. Клещевой энцефалит в Приморском крае. Владивосток: Дальнаука, 1997. 190 с.
2. Погодина В.В., Фролова М.П., Ерман Б.А. Хронический клещевой энцефалит. Новосибирск: Наука, 1986. 232 с.
3. Chausov E.V., Ternovoi V.A., Protopopova E.V. et al. Variability of the Tick-Borne Encephalitis Virus Genome in the 5' Noncoding Region Derived from Ticks Ixodes persulcatus and Ixodes pavlovskyi in Western Siberia // Vector Borne Zoonotic Dis. 2009. Oct 30. [Epub ahead of print].
4. Corver J., Lenches E., Smith K. et al. Fine mapping of a cis-acting sequence element in yellow fever virus RNA that is required for RNA replication and cyclization // Journal Virol. 2003. Vol. 77. P. 2265- 2270.
5. Ecker M. Allison S.L., Meixner T., Heinz F.X. Sequence analysis and genetic classification of tick-borne encephalitis viruses from Europe and Asia // J. Gen. Virol. 1999. Vol. 80. P. 179-185.
6. Filomatori C.V., Lodeiro M.F., Alvarez D.E. et al. 5' RNA enement promotes dengue virus synthesis on a circular genome // Genes Dev. 2006. Vol. 20. P. 2238-2249.
7. Hayasaka D., Gritsun T.S., Yoshii K. et al. Amino acid changes responsible for attenuation of neurovirulence in an infectious cDNA clone of the Oshima strain of tick-borne encephalitis virus // J. Gen. Virol. 2004. Vol. 85. P. 1007-1018.
8. Holzmann H., Stiasny K., Ecker M. et al. Characterization of monoclonal antibody-escape mutants of tick-borne encephalitis virus with reduced neuroinvasiveness in mice // J. Gen. Virol. 1997. Vol. 78. P. 31-37.
9. Khromykh A.A., Kondratieva N., Sgro J-Y. et al. Significance in replication of the terminal nucleotides of the flavivirus genome // J. Virol. 2003. Vol. 77 (19). P. 10623-10629.
10. Mackensie J.M., Khromykh A.A., Jones M.K., Westaway E.G. Subcelluar localization and some biochemical properties of the Flavivirus Kunjin nonstructural proteins NS2A and NS4A // Virology. 1998. Vol. 245. P. 203-215.
11. Mandl C.W., Alison S.L., Holzman H. et al. Attenuation of tickborne encephalitis by sructure-based site-specific mutagenesis of putative flavivirus receptor binding site // J. Virol.- 2000. Vol. 74 (20). P. 9601-9609.
12. Park G.S., Morris K.L., Hallett R.G. et al. Identification of Residues Critical for the Interferon Antagonist Function of Langat Virus NS5 Reveals a Role for the RNA-Dependent RNA Polymerase Domain // J. Virol. 2007. Vol. 81. P. 6936-6946.
13. Tamura K., Dudley J., Nei M. & Kumar S. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0 // Molecular Biology and Evolution. 2007. Vol. 24. P. 1596-1599.
14. Ternovoi V.A., Protopopova E.V., Chausov E.V. et al. Novel variant of Tick-borne encephalitis virus, Russia // Emerg. Infect. Dis. 2007. Vol. 13. P. 1574-1578.
Рецензия
Для цитирования:
Чаусов Е.В., Терновой В.А., Протопопова Е.В., Леонова Г.Н., Локтев В.Б., ., ., ., ., . МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНОМА ВЫСОКОПАТОГЕННОГО ШТАММА ГЛУБИННОЕ/2004 ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА. Тихоокеанский медицинский журнал. 2010;(3):27-30.
For citation:
., ., ., ., ., Chausov E.V., Ternovoy V.A., Protopopova E.V., Leonova G.N., Loktev V.B. Molecular genetic analysis of genome of Glubinnoe/2004 high virulent strain of tick-bone encephalitis. Pacific Medical Journal. 2010;(3):27-30. (In Russ.)
Просмотров: 117
Послать статью по эл. почте 