To a question on evolution of the Hantavirus genotype Puumala
Abstract
Puumala Hantavirus infection forms ten clusters, having relative geographical specificity. Stellate structure of trees assumes an old divergence of the given groups. In each group (except for Siberian) connection with one kind of rodents of owners is kept. Comparing intra- and intercluster genetic distances and levels of homology between sequences, it is possible to assume an opportunity of absolutely recent «switching» of viruses Puumala with Clethrionomys glareolus on Clethrionomys rufocanus in Western Siberia where the genetic affinity of these rodents can be caused by their long coexistence in overlapped ecological niches.
About the Authors
Z. S. Tyulko
Omsk state medical academy
Russian Federation
Russian Federation
V. V. Jakimenko
Omsk scientific research institute of the natural infections Rospotrebnadzor
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Абрамсон Н.И. // Вестник ВОГиС. - 2007. - Т. 11, №2.-С. 307-331.
2. Айала Ф., Кайгер Дж. Современная генетика. — М.: Мир, 1988.
3. Банникова А.А. // Журн. общей биологии. — 2004. — Т. 65. -№4.- С. 278-305.
4. Бородин А. В. // Современное состояние и история животного мира Западно-Сибирской низменности. - Свердловск, 1988. - С. 20-30.
5. Бородин А.В. // История современной фауны Южного Урала. - Свердловск, 1992. - С. 90-97.
6. Колесников А.Д. // Природа и природопользование на рубеже 21 века : материалы межрегион. науч.- практ. конф. — Омск, 1999. — С. 44—45.
7. Колесников А.Д. // Природа и природопользование на рубеже 21 века : материалы межрегион. науч.- практ. конф - Омск, 1999. - С. 45-49.
8. Попадьин К.Ю. Эволюция бесполых линий: эколого-генетические механизмы происхождения и поддержания: автореф. дис.… канд. биол. наук. — М., 2005.
9. Conroy C.J., Cook J.A. //J. Mammal. Evol. - 1999. - No. 6. - P. 221-245.
10. Dekonenko A., Yakimenko V., Ivanov A. et al. // Infect. Genet. Evol. -2003. - Vol. 3, No. 4. - P. 245-257.
11. Edwards S. V., Beerli P. // Evolution. -2000. - Vol. 54. - P. 1839-1854.
12. Fedorov V.B. // Proc. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. - 1999. - No. 266. - P. 621-626.
13. Fedorov V.B., Stenseth N.C. // Proc. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. - 2002. - No. 269. - P. 2071-2077.
14. Hughes A.L., Friedman R. // Mol. Biol. Evol. - 2000. - Vol. 17, No. 10. - P. 1558-1568.
15. Lopez J. V., Culver M., Stephens J.C. et al. // Mol. Biol. Evol. - 1997. - No. 14. - P. 277-286.
16. Martin Y., Gerlach E., Schlotter C., Meyer A. // Mol. Phylogen. Evol. - 2000. - Vol. 16. - P.37-47.
17. Matson С W., Baker R.J. // Mol. Biol. Evol. - 2001. - Vol. 18, No. 8. -P. 1494-1501.
18. Murphy W.J., Eizirik E., Johnson W.E. et al. // Nature. - 2001. - No. 409. - Р. 614-618.
19. Plyusnin A. // Arch. Virol. - 2002. - Vol. 147. - P. 665-682.
20. Plyusnin A., Kukkonen К J., Plyusnina A. et al. // EMBO J. - 2002. - Vol. 21, No. 6. - P. 1479-1503.
21. Sibold C., Meisel H., Kruger D.H. et al. // J. Virol. - 1999. - Vol. 73, No. 1. - P.667-675.
22. Sironen T., Vaheri A., Plysnin A. //J. Virol. - 2001. - Vol. 75, No. 23. - P. 11803-11810.
23. Tesakov A. // Acta Zool. Cracov. - 1996. - Vol. 39, No. 1. - P. 541-547.
24. Vapalahti O., Lundkvist A., Fedorov V. et al. // J. Virol. - 1999. - Vol. 73, No. 7. - P. 5586-5592.
Review
For citations:
Tyulko Z.S., Jakimenko V.V. To a question on evolution of the Hantavirus genotype Puumala. Pacific Medical Journal. 2008;(2):27-32. (In Russ.)
Views:
233
Email this article 